Никола, как мы видим из истории преобразований FCK Editor, изменения вносились только в PopUp окна (рисунки, файловый браузер и т.п.). Если по ночам редактор вообще не грузится, то дело не в них. Было бы в них - редактор грузился бы, не открывалась бы всего пара диалоговых окон.
Остальные изменения - это элементарная замена расширений у файлов с .html на .php (это связяно также с PopUp окнами). Javascript работает одинаково и на html и на php.
Причем, даже в "старом" варианте загрузка редактора производилась инклудом файла addconfig.php, а всего в нём 16 php-файлов, причём в 6 из них есть javascript-код.
Так что ваша проблема никак не связана с расширениями файлов.
А вот о Json нужно почитать. FCK Editor нафарширован явой по самые помидоры, точнее он полностью состоит из ява-скрипта, а остальное - просто "навесное оборудование". Так что запросто может возникнуть конфликт интересов с джейсоном.
НО ПОЧЕМУ, чёрт возьми, ТОЛЬКО ПО НОЧАМ???
11 минут и 20 секунд спустя:
Пока верстался номер...
www и не www - это зависит от особенностей настроек вашего браузера (ну там атозаполнение адресов и п.х.). Например, IE иногда заставляет заново авторизовываться в Strawberry, если предпринята попытка войти в админку без www, а предыдущая авторизация была с www.
А также это может зависеть от настроек web-сервера, хотя такое сейчас встречается редко, но встречается.
По идее, запись www.мойсайт.мойдомен.ру некорректна, так как, в основном, www бывает у сайтов предыдущего уровня: www.мойдомен.ру.